วัดบางยี่โท ได้จัดตั้งเป็นวัด ตั้งแต่ พ.ศ.2378 ได้รับวิสุงคามสีมา ครั้งสุดท้าย เมื่อวันที่ 25 สิงหาคม พ.ศ.2462 หลักฐานท้องถิ่นสันนิษฐานว่า วัดแห่งนี้ต่อตั้งขึ้นในสมัยปลายกรุงศรีอยุธยา นับเป็นมรดกทางวัฒนธรรมที่ทรงคุณค่าและได้รับการบูรณะรักษาต่อเนื่องมาจนถึงปัจจุบัน