วัดมารวิชัย ตั้งพื้นที่เป็นที่ราบลุ่ม ตั้งอยู่ริมคลองขนมจีน เนื้อที่ 21 ไร่ 65 ตารางวา  ตามคำบอกเล่าสืบต่อกันมาว่าเป็นวัดเก่าแก่ตั้งแต่ครั้งกรุงศรีอยุธยา สมัยก่อนมีว่าชื่อ วัดผจญมาร หรือชาวบ้านเรียกกันว่าวัดจนมาร วัดมาร ต่อมาสมัยหลวงพ่อมีจึงได้เปลี่ยนชื่อจากวัดผจญมาร เป็น “วัดมารวิชัย” แปลว่าการมีชัยชนะแก่มาร มารเลิกมาตอแย

         บริเวณทิศเหนือของวัด สมัยก่อนจะเป็นที่เก็บศพ  และเผาศพของพม่า เมื่อสมัยพม่ายกทัพมาตีกรุงศรีอยุธยา ซึ่งบริเวณนี้เรียกว่าดงสะแก ลือกันว่าดงสะแกนี้มีความเฮี้ยนมาก เป็นที่มาของตำนานวัดมาร ผีดุ

         ต่อมาในยุคของ หลวงพ่อมี เขมธัมโม อดีตเจ้าอาวาสและพระเกจิอาจารย์ชื่อดัง (ซึ่งท่านเป็นศิษย์เรียนวิชากรรมฐานมาจากหลวงพ่อปาน วัดบางนมโค และหลวงพ่อจง วัดหน้าต่างนอก) ท่านเห็นว่าชื่อเดิมไม่เป็นมงคล จึงได้ทำการเปลี่ยนชื่อวัดใหม่เป็น "วัดมารวิชัย" ซึ่งมีความหมายอันเป็นมงคลสื่อถึง "การมีชัยชนะเหนือหมู่มาร" พร้อมทั้งได้บูรณะปฏิสังขรณ์เสนาสนะ โรงเรียน และสถานีอนามัย จนวัดเจริญรุ่งเรืองสูงสุดและเป็นที่รู้จักของพุทธศาสนิกชนทั่วประเทศ ปัจจุบันมีพระครูวิชัยพลากร ดำรงตำแหน่งเจ้าอาวาส